A USP tem 11 Centros de Pesquisa e Inovação Especiais (Cepix).

Os centros fazem parte do Programa USP de Incentivo a Centros de Pesquisa e Inovação Especiais (Cepix).

O projeto é voltado ao fomento e à continuidade das atividades de pesquisa, inovação e difusão anteriormente contempladas pelo projeto de Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (Cepids), financiados pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (Fapesp).

A criação dos Cepix visa a manter os Cepids que estavam prestes a alcançar o prazo de término estabelecido pela Fapesp.

Centros de Pesquisa e Inovação Especiais (Cepix)
Centro de Estudos da Violência
Centro de Estudos da Metrópole
Centro de Pesquisa sobre o Genoma Humano e Células-Tronco
Centro de Pesquisa em Processos Redox em Biomedicina
Centro de Pesquisa em Alimentos
Centro de Pesquisa e Inovação em Biodiversidade e Fármacos
Centro de Pesquisa em Terapia Celular
Centro de Pesquisa em Doenças Inflamatórias
Centro de Pesquisa em Matemática Aplicada à Indústria
Centro de Pesquisa em Óptica e Fotônica
Centro de Pesquisa em Neuromatemática