A Agência USP de Inovação pode ser definida como uma “rede de cooperação” organizada através de pólos. Em cada campus existe um Pólo USPInovação, constituído conforme a vocação e as potencialidades de cada campus ou região, encabeçado pelos presidentes das Comissões de Pesquisa e de Cultura e Extensão Universitária das diferentes unidades.

Cada polo é constituído conforme a vocação e as potencialidades de cada campus ou região.